2000-luku: Yrityskauppoja ja tehdas Heinävedelle
2000-luku oli merkittävien yrityskauppojen aikaa. Berner osti tunnettuja brändejä, kuten Nokian Jalkineet, LV herkän ihon tuotteet, Herbina-hygieniasarjan, Rajamäen etikka -liiketoiminnan sekä Grow How -liiketoiminnan, jonka nimi muutettiin myöhemmin GreenCareksi.
Ruotsista ostettiin kasvinsuojeluaineiden tukkuliike Gullviks, joka myöhemmin sulautui yhteen Bröderna Berner Handels Ab:n kanssa.
Norjalaiselta Reidar Jakobsenilta ostetaan Heinäveden teknokemian tehdas, jonne siirretään Herttoniemen tehtaan vesipohjaisten hygieniatuotteiden tuotanto 2001.
Vuonna 2008 päätettiin keskittää yhtiön kaikki logistiikkatoiminnot uuteen logistiikkakeskukseen Vantaan Viinikkalaan. Logistiikkakeskus otettiin käyttöön tammikuussa 2009.